Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH13P55290 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH13P55290 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH13P55290 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH13P55290 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH13P55290 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH13P55290 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH13P55290 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH13P55290 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH13P55290 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH13P55290 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH13P55290 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH13P55290 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDH13P55290 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH13P55290 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH13P55290 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH13P55290 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH13P55290 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH13P55290 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH13P55290 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH13P55290 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH13P55290 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH13P55290 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH13P55290 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH13P55290 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH13P55290 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH13P55290 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH13P55290 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH13P55290 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH13P55290 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH13P55290 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH13P55290 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH13P55290 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH13P55290 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH13P55290 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH13P55290 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH13P55290 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH13P55290 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH13P55290 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH13P55290 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH13P55290 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH13P55290 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH13P55290 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH13P55290 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH13P55290 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH13P55290 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH13P55290 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH13P55290 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH13P55290 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH13P55290 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH13P55290 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH13P55290 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH13P55290 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH13P55290 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH13P55290 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH13P55290 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH13P55290 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH13P55290 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH13P55290 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH13P55290 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH13P55290 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH13P55290 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH13P55290 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH13P55290 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH13P55290 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH13P55290 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH13P55290 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH13P55290 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH13P55290 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH13P55290 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH13P55290 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH13P55290 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH13P55290 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH13P55290 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH13P55290 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH13P55290 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH13P55290 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH13P55290 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH13P55290 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH13P55290 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH13P55290 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH13P55290 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH13P55290 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH13P55290 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH13P55290 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH13P55290 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH13P55290 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH13P55290 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH13P55290 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms