Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CASP7P55210 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CASP7P55210 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CASP7P55210 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CASP7P55210 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CASP7P55210 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CASP7P55210 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CASP7P55210 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CASP7P55210 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CASP7P55210 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CASP7P55210 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CASP7P55210 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CASP7P55210 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CASP7P55210 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CASP7P55210 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CASP7P55210 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CASP7P55210 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CASP7P55210 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CASP7P55210 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CASP7P55210 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CASP7P55210 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CASP7P55210 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CASP7P55210 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CASP7P55210 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CASP7P55210 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CASP7P55210 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CASP7P55210 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CASP7P55210 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CASP7P55210 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CASP7P55210 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CASP7P55210 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CASP7P55210 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CASP7P55210 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CASP7P55210 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CASP7P55210 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP7P55210 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP7P55210 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP7P55210 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP7P55210 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CASP7P55210 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CASP7P55210 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CASP7P55210 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CASP7P55210 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP7P55210 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP7P55210 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP7P55210 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP7P55210 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CASP7P55210 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CASP7P55210 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CASP7P55210 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP7P55210 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP7P55210 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP7P55210 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP7P55210 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CASP7P55210 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CASP7P55210 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CASP7P55210 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CASP7P55210 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CASP7P55210 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CASP7P55210 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CASP7P55210 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CASP7P55210 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CASP7P55210 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CASP7P55210 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CASP7P55210 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CASP7P55210 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CASP7P55210 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CASP7P55210 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CASP7P55210 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CASP7P55210 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CASP7P55210 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CASP7P55210 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CASP7P55210 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CASP7P55210 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CASP7P55210 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CASP7P55210 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CASP7P55210 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CASP7P55210 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CASP7P55210 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CASP7P55210 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP7P55210 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP7P55210 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP7P55210 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP7P55210 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CASP7P55210 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CASP7P55210 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CASP7P55210 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CASP7P55210 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CASP7P55210 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CASP7P55210 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CASP7P55210 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CASP7P55210 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CASP7P55210 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CASP7P55210 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CASP7P55210 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms