Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC3P51654 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPC3P51654 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC3P51654 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC3P51654 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPC3P51654 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC3P51654 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC3P51654 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPC3P51654 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPC3P51654 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPC3P51654 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC3P51654 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPC3P51654 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC3P51654 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC3P51654 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC3P51654 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPC3P51654 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC3P51654 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC3P51654 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPC3P51654 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPC3P51654 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPC3P51654 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC3P51654 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC3P51654 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC3P51654 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPC3P51654 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPC3P51654 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPC3P51654 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPC3P51654 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPC3P51654 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPC3P51654 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC3P51654 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC3P51654 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC3P51654 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPC3P51654 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPC3P51654 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPC3P51654 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPC3P51654 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC3P51654 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC3P51654 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC3P51654 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC3P51654 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPC3P51654 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPC3P51654 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPC3P51654 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPC3P51654 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPC3P51654 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPC3P51654 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPC3P51654 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPC3P51654 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC3P51654 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPC3P51654 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPC3P51654 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GPC3P51654 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPC3P51654 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPC3P51654 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPC3P51654 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC3P51654 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC3P51654 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC3P51654 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC3P51654 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPC3P51654 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPC3P51654 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GPC3P51654 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPC3P51654 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPC3P51654 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GPC3P51654 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPC3P51654 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPC3P51654 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPC3P51654 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPC3P51654 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPC3P51654 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPC3P51654 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC3P51654 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC3P51654 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC3P51654 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC3P51654 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPC3P51654 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPC3P51654 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC3P51654 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC3P51654 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC3P51654 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC3P51654 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC3P51654 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC3P51654 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC3P51654 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC3P51654 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC3P51654 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC3P51654 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC3P51654 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC3P51654 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC3P51654 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC3P51654 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC3P51654 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms