Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF144AP50876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF144AP50876 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF144AP50876 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF144AP50876 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF144AP50876 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF144AP50876 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms