Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfkmP47857 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfkmP47857 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PfkmP47857 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfkmP47857 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PfkmP47857 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PfkmP47857 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PfkmP47857 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfkmP47857 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PfkmP47857 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PfkmP47857 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PfkmP47857 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PfkmP47857 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PfkmP47857 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PfkmP47857 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PfkmP47857 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PfkmP47857 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PfkmP47857 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PfkmP47857 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfkmP47857 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfkmP47857 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfkmP47857 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PfkmP47857 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms