Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGIRP43119 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGIRP43119 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGIRP43119 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGIRP43119 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGIRP43119 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGIRP43119 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGIRP43119 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGIRP43119 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGIRP43119 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGIRP43119 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGIRP43119 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGIRP43119 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGIRP43119 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGIRP43119 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGIRP43119 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTGIRP43119 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGIRP43119 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGIRP43119 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGIRP43119 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGIRP43119 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGIRP43119 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms