Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYLC1P35663 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYLC1P35663 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CYLC1P35663 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYLC1P35663 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYLC1P35663 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYLC1P35663 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYLC1P35663 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYLC1P35663 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLC1P35663 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYLC1P35663 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYLC1P35663 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms