Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDIT3P35638 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
DDIT3P35638 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDIT3P35638 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDIT3P35638 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDIT3P35638 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDIT3P35638 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
DDIT3P35638 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDIT3P35638 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDIT3P35638 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
DDIT3P35638 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDIT3P35638 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDIT3P35638 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
DDIT3P35638 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDIT3P35638 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDIT3P35638 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDIT3P35638 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms