Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCR5P32302 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCR5P32302 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CXCR5P32302 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCR5P32302 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCR5P32302 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCR5P32302 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXCR5P32302 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCR5P32302 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms