Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTX2P32243 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OTX2P32243 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTX2P32243 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OTX2P32243 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTX2P32243 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTX2P32243 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTX2P32243 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTX2P32243 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTX2P32243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTX2P32243 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTX2P32243 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTX2P32243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTX2P32243 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTX2P32243 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTX2P32243 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTX2P32243 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
OTX2P32243 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTX2P32243 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTX2P32243 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTX2P32243 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTX2P32243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OTX2P32243 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTX2P32243 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTX2P32243 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTX2P32243 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTX2P32243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTX2P32243 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTX2P32243 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTX2P32243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTX2P32243 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTX2P32243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTX2P32243 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTX2P32243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTX2P32243 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTX2P32243 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTX2P32243 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTX2P32243 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTX2P32243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTX2P32243 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTX2P32243 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTX2P32243 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTX2P32243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTX2P32243 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTX2P32243 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTX2P32243 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTX2P32243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTX2P32243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTX2P32243 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTX2P32243 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTX2P32243 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTX2P32243 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTX2P32243 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTX2P32243 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTX2P32243 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTX2P32243 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTX2P32243 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTX2P32243 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTX2P32243 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTX2P32243 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTX2P32243 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTX2P32243 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTX2P32243 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTX2P32243 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTX2P32243 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTX2P32243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTX2P32243 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTX2P32243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTX2P32243 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTX2P32243 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTX2P32243 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTX2P32243 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTX2P32243 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTX2P32243 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTX2P32243 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTX2P32243 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTX2P32243 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTX2P32243 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTX2P32243 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTX2P32243 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTX2P32243 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTX2P32243 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTX2P32243 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTX2P32243 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTX2P32243 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTX2P32243 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTX2P32243 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTX2P32243 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTX2P32243 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTX2P32243 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTX2P32243 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTX2P32243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTX2P32243 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTX2P32243 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTX2P32243 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms