Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH3A1P30838 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH3A1P30838 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALDH3A1P30838 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH3A1P30838 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH3A1P30838 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH3A1P30838 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms