Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMOD1P29536 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMOD1P29536 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMOD1P29536 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD1P29536 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LMOD1P29536 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD1P29536 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD1P29536 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD1P29536 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms