Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN6P29350 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN6P29350 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN6P29350 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN6P29350 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN6P29350 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN6P29350 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN6P29350 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms