Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 YLR349WYLR349W 507 nt9.49□□□□□ -0.89
BRF1P29056 HXK1YFR053C 1458 nt9.48□□□□□ -0.89
BRF1P29056 ZRT3YKL175W 1512 nt9.48□□□□□ -0.89
BRF1P29056 FUN14YAL008W 597 nt9.47□□□□□ -0.89
BRF1P29056 GND1YHR183W 1470 nt9.46□□□□□ -0.9
BRF1P29056 LOT5YKL183W 921 nt9.45□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YMR209CYMR209C 1374 nt9.43□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YPI1YFR003C 468 nt9.43□□□□□ -0.9
BRF1P29056 ADH1YOL086C 1047 nt9.43□□□□□ -0.9
BRF1P29056 HOL1YNR055C 1761 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 ADH7YCR105W 1086 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.42□□□□□ -0.9
BRF1P29056 ALD5YER073W 1563 nt9.41□□□□□ -0.9
BRF1P29056 SED1YDR077W 1017 nt9.41□□□□□ -0.9
BRF1P29056 YJL195CYJL195C 702 nt9.41□□□□□ -0.9
BRF1P29056 PAU15YIR041W 375 nt9.4□□□□□ -0.9
BRF1P29056 FCY21YER060W 1587 nt9.39□□□□□ -0.91
BRF1P29056 SMM1YNR015W 1155 nt9.39□□□□□ -0.91
BRF1P29056 FRA1YLL029W 2250 nt9.38□□□□□ -0.91
BRF1P29056 APT2YDR441C 546 nt9.37□□□□□ -0.91
BRF1P29056 LIP1YMR298W 453 nt9.37□□□□□ -0.91
BRF1P29056 YDR306CYDR306C 1437 nt9.36□□□□□ -0.91
BRF1P29056 GNP1YDR508C 1992 nt9.35□□□□□ -0.91
BRF1P29056 DBP1YPL119C 1854 nt9.34□□□□□ -0.91
BRF1P29056 MTO1YGL236C 2010 nt9.32□□□□□ -0.92
BRF1P29056 YJL067WYJL067W 351 nt9.32□□□□□ -0.92
BRF1P29056 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.32□□□□□ -0.92
BRF1P29056 HXT1YHR094C 1713 nt9.31□□□□□ -0.92
BRF1P29056 PRY1YJL079C 900 nt9.3□□□□□ -0.92
BRF1P29056 YPL251WYPL251W 303 nt9.3□□□□□ -0.92
BRF1P29056 YBL086CYBL086C 1401 nt9.3□□□□□ -0.92
BRF1P29056 YEL008WYEL008W 381 nt9.28□□□□□ -0.92
BRF1P29056 RIB2YOL066C 1776 nt9.27□□□□□ -0.92
BRF1P29056 ESS1YJR017C 513 nt9.27□□□□□ -0.93
BRF1P29056 CPD1YGR247W 720 nt9.26□□□□□ -0.93
BRF1P29056 BRR1YPR057W 1026 nt9.26□□□□□ -0.93
BRF1P29056 LEU9YOR108W 1815 nt9.26□□□□□ -0.93
BRF1P29056 MEP3YPR138C 1470 nt9.25□□□□□ -0.93
BRF1P29056 PSD1YNL169C 1503 nt9.25□□□□□ -0.93
BRF1P29056 HXT12YIL170W 1374 nt9.24□□□□□ -0.93
BRF1P29056 TOA2YKL058W 369 nt9.24□□□□□ -0.93
BRF1P29056 ILV3YJR016C 1758 nt9.23□□□□□ -0.93
BRF1P29056 VRG4YGL225W 1014 nt9.23□□□□□ -0.93
BRF1P29056 YMR103CYMR103C 363 nt9.23□□□□□ -0.93
BRF1P29056 GPN2YOR262W 1044 nt9.23□□□□□ -0.93
BRF1P29056 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.22□□□□□ -0.93
BRF1P29056 SHY1YGR112W 1170 nt9.2□□□□□ -0.94
BRF1P29056 YJL055WYJL055W 738 nt9.19□□□□□ -0.94
BRF1P29056 YNL024CYNL024C 741 nt9.19□□□□□ -0.94
BRF1P29056 TPN1YGL186C 1740 nt9.19□□□□□ -0.94
BRF1P29056 CSM1YCR086W 573 nt9.18□□□□□ -0.94
BRF1P29056 NAP1YKR048C 1254 nt9.18□□□□□ -0.94
BRF1P29056 GND2YGR256W 1479 nt9.17□□□□□ -0.94
BRF1P29056 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.16□□□□□ -0.94
BRF1P29056 PUS7YOR243C 2031 nt9.15□□□□□ -0.94
BRF1P29056 TOM71YHR117W 1920 nt9.15□□□□□ -0.94
BRF1P29056 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.15□□□□□ -0.94
BRF1P29056 UFO1YML088W 2007 nt9.14□□□□□ -0.95
BRF1P29056 CYT1YOR065W 930 nt9.14□□□□□ -0.95
BRF1P29056 LSB5YCL034W 1065 nt9.13□□□□□ -0.95
BRF1P29056 HIS2YFR025C 1008 nt9.12□□□□□ -0.95
BRF1P29056 URA6YKL024C 615 nt9.12□□□□□ -0.95
BRF1P29056 YOR325WYOR325W 474 nt9.12□□□□□ -0.95
BRF1P29056 BNI5YNL166C 1347 nt9.11□□□□□ -0.95
BRF1P29056 SEN2YLR105C 1134 nt9.11□□□□□ -0.95
BRF1P29056 YOR072WYOR072W 315 nt9.11□□□□□ -0.95
BRF1P29056 MDL2YPL270W 2322 nt9.11□□□□□ -0.95
BRF1P29056 CWC15YDR163W 528 nt9.1□□□□□ -0.95
BRF1P29056 NUC1YJL208C 990 nt9.1□□□□□ -0.95
BRF1P29056 PHO23YNL097C 993 nt9.1□□□□□ -0.95
BRF1P29056 NSG2YNL156C 900 nt9.1□□□□□ -0.95
BRF1P29056 YJL118WYJL118W 660 nt9.09□□□□□ -0.95
BRF1P29056 OPI10YOL032W 741 nt9.09□□□□□ -0.95
BRF1P29056 OYE3YPL171C 1203 nt9.09□□□□□ -0.95
BRF1P29056 SAM2YDR502C 1155 nt9.08□□□□□ -0.96
BRF1P29056 RPT5YOR117W 1305 nt9.07□□□□□ -0.96
BRF1P29056 SEC61YLR378C 1443 nt9.07□□□□□ -0.96
BRF1P29056 MSC1YML128C 1542 nt9.07□□□□□ -0.96
BRF1P29056 CCT5YJR064W 1689 nt9.07□□□□□ -0.96
BRF1P29056 COQ8YGL119W 1506 nt9.06□□□□□ -0.96
BRF1P29056 ALR1YOL130W 2580 nt9.06□□□□□ -0.96
BRF1P29056 PCP1YGR101W 1041 nt9.06□□□□□ -0.96
BRF1P29056 PUP1YOR157C 786 nt9.06□□□□□ -0.96
BRF1P29056 UGP1YKL035W 1500 nt9.05□□□□□ -0.96
BRF1P29056 YLR173WYLR173W 1827 nt9.05□□□□□ -0.96
BRF1P29056 SAM3YPL274W 1764 nt9.05□□□□□ -0.96
BRF1P29056 GAL3YDR009W 1563 nt9.05□□□□□ -0.96
BRF1P29056 OXA1YER154W 1209 nt9.05□□□□□ -0.96
BRF1P29056 PET8YNL003C 855 nt9.04□□□□□ -0.96
BRF1P29056 SFL1YOR140W 2301 nt9.04□□□□□ -0.96
BRF1P29056 CCT2YIL142W 1584 nt9.03□□□□□ -0.96
BRF1P29056 RIB7YBR153W 735 nt9.03□□□□□ -0.96
BRF1P29056 ARO8YGL202W 1503 nt9.01□□□□□ -0.97
BRF1P29056 FUB1YCR076C 753 nt8.99□□□□□ -0.97
BRF1P29056 YER188WYER188W 720 nt8.99□□□□□ -0.97
BRF1P29056 RAS2YNL098C 969 nt8.99□□□□□ -0.97
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