Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 YPL251WYPL251W 303 nt12.04□□□□□ -0.48
PRP45P28004 QDR2YIL121W 1629 nt12.03□□□□□ -0.48
PRP45P28004 YER152W-AYER152W-A 567 nt12.02□□□□□ -0.49
PRP45P28004 POT1YIL160C 1254 nt12.01□□□□□ -0.49
PRP45P28004 MHF1YOL086W-A 273 nt12.01□□□□□ -0.49
PRP45P28004 RIB7YBR153W 735 nt12□□□□□ -0.49
PRP45P28004 MEP3YPR138C 1470 nt12□□□□□ -0.49
PRP45P28004 YCP4YCR004C 744 nt11.99□□□□□ -0.49
PRP45P28004 YMR103CYMR103C 363 nt11.99□□□□□ -0.49
PRP45P28004 RPT5YOR117W 1305 nt11.99□□□□□ -0.49
PRP45P28004 SAM3YPL274W 1764 nt11.98□□□□□ -0.49
PRP45P28004 YGR259CYGR259C 441 nt11.97□□□□□ -0.49
PRP45P28004 APS2YJR058C 444 nt11.97□□□□□ -0.49
PRP45P28004 PRM5YIL117C 957 nt11.96□□□□□ -0.49
PRP45P28004 YJL225CYJL225C 5277 nt11.95□□□□□ -0.5
PRP45P28004 BRR1YPR057W 1026 nt11.95□□□□□ -0.5
PRP45P28004 YKR005CYKR005C 1578 nt11.94□□□□□ -0.5
PRP45P28004 YPR126CYPR126C 309 nt11.94□□□□□ -0.5
PRP45P28004 LEU9YOR108W 1815 nt11.94□□□□□ -0.5
PRP45P28004 DBP1YPL119C 1854 nt11.93□□□□□ -0.5
PRP45P28004 SSN3YPL042C 1668 nt11.92□□□□□ -0.5
PRP45P28004 SAM50YNL026W 1455 nt11.92□□□□□ -0.5
PRP45P28004 NUC1YJL208C 990 nt11.92□□□□□ -0.5
PRP45P28004 HIF1YLL022C 1158 nt11.92□□□□□ -0.5
PRP45P28004 YBL086CYBL086C 1401 nt11.92□□□□□ -0.5
PRP45P28004 CTI6YPL181W 1521 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP45P28004 IRC24YIR036C 792 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP45P28004 NIF3YGL221C 867 nt11.9□□□□□ -0.5
PRP45P28004 BUD20YLR074C 501 nt11.89□□□□□ -0.51
PRP45P28004 TOA2YKL058W 369 nt11.88□□□□□ -0.51
PRP45P28004 PHO23YNL097C 993 nt11.88□□□□□ -0.51
PRP45P28004 KRE1YNL322C 942 nt11.88□□□□□ -0.51
PRP45P28004 BNI5YNL166C 1347 nt11.87□□□□□ -0.51
PRP45P28004 IGD1YFR017C 588 nt11.85□□□□□ -0.51
PRP45P28004 DAK2YFL053W 1776 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP45P28004 HXT1YHR094C 1713 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP45P28004 IML3YBR107C 738 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP45P28004 MSC1YML128C 1542 nt11.84□□□□□ -0.51
PRP45P28004 TPS1YBR126C 1488 nt11.82□□□□□ -0.52
PRP45P28004 GND2YGR256W 1479 nt11.79□□□□□ -0.52
PRP45P28004 BMT6YLR063W 1098 nt11.79□□□□□ -0.52
PRP45P28004 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.77□□□□□ -0.53
PRP45P28004 YCR025CYCR025C 411 nt11.75□□□□□ -0.53
PRP45P28004 OYE2YHR179W 1203 nt11.75□□□□□ -0.53
PRP45P28004 IPL1YPL209C 1104 nt11.75□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 SWM1YDR260C 513 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 YNL024CYNL024C 741 nt11.74□□□□□ -0.53
PRP45P28004 RAS2YNL098C 969 nt11.71□□□□□ -0.53
PRP45P28004 UFO1YML088W 2007 nt11.7□□□□□ -0.54
PRP45P28004 SEC61YLR378C 1443 nt11.7□□□□□ -0.54
PRP45P28004 PRP4YPR178W 1398 nt11.7□□□□□ -0.54
PRP45P28004 OXA1YER154W 1209 nt11.69□□□□□ -0.54
PRP45P28004 CDD1YLR245C 429 nt11.69□□□□□ -0.54
PRP45P28004 EAF3YPR023C 1206 nt11.69□□□□□ -0.54
PRP45P28004 ACO2YJL200C 2370 nt11.68□□□□□ -0.54
PRP45P28004 LYS20YDL182W 1287 nt11.68□□□□□ -0.54
PRP45P28004 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.67□□□□□ -0.54
PRP45P28004 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.67□□□□□ -0.54
PRP45P28004 FUB1YCR076C 753 nt11.67□□□□□ -0.54
PRP45P28004 SAM2YDR502C 1155 nt11.65□□□□□ -0.54
PRP45P28004 YER188WYER188W 720 nt11.64□□□□□ -0.55
PRP45P28004 SHY1YGR112W 1170 nt11.64□□□□□ -0.55
PRP45P28004 TMA23YMR269W 636 nt11.64□□□□□ -0.55
PRP45P28004 DPS1YLL018C 1674 nt11.64□□□□□ -0.55
PRP45P28004 NAS2YIL007C 663 nt11.62□□□□□ -0.55
PRP45P28004 YOR343CYOR343C 327 nt11.61□□□□□ -0.55
PRP45P28004 YMR007WYMR007W 381 nt11.6□□□□□ -0.55
PRP45P28004 RPL12BYDR418W 498 nt11.59□□□□□ -0.55
PRP45P28004 SPS100YHR139C 981 nt11.58□□□□□ -0.56
PRP45P28004 OYE3YPL171C 1203 nt11.58□□□□□ -0.56
PRP45P28004 DDI1YER143W 1287 nt11.57□□□□□ -0.56
PRP45P28004 FLX1YIL134W 936 nt11.57□□□□□ -0.56
PRP45P28004 IMO32YGR031W 1029 nt11.56□□□□□ -0.56
PRP45P28004 URA6YKL024C 615 nt11.56□□□□□ -0.56
PRP45P28004 PAU21YOR394W 495 nt11.56□□□□□ -0.56
PRP45P28004 PAU22YPL282C 495 nt11.56□□□□□ -0.56
PRP45P28004 RCR1YBR005W 642 nt11.53□□□□□ -0.56
PRP45P28004 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.52□□□□□ -0.57
PRP45P28004 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.52□□□□□ -0.57
PRP45P28004 DLD2YDL178W 1593 nt11.51□□□□□ -0.57
PRP45P28004 YOR268CYOR268C 399 nt11.5□□□□□ -0.57
PRP45P28004 LSM5YER146W 282 nt11.49□□□□□ -0.57
PRP45P28004 PET8YNL003C 855 nt11.49□□□□□ -0.57
PRP45P28004 THP3YPR045C 1413 nt11.48□□□□□ -0.57
PRP45P28004 FLR1YBR008C 1647 nt11.48□□□□□ -0.57
PRP45P28004 SER2YGR208W 930 nt11.47□□□□□ -0.57
PRP45P28004 OSH7YHR001W 1314 nt11.45□□□□□ -0.58
PRP45P28004 HRA1HRA1 564 nt11.45□□□□□ -0.58
PRP45P28004 RSC8YFR037C 1674 nt11.44□□□□□ -0.58
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