Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARNTP27540 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTP27540 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTP27540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTP27540 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARNTP27540 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARNTP27540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARNTP27540 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARNTP27540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARNTP27540 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARNTP27540 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARNTP27540 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARNTP27540 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARNTP27540 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARNTP27540 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARNTP27540 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARNTP27540 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARNTP27540 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARNTP27540 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARNTP27540 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARNTP27540 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARNTP27540 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARNTP27540 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARNTP27540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARNTP27540 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARNTP27540 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARNTP27540 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARNTP27540 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARNTP27540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARNTP27540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARNTP27540 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARNTP27540 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARNTP27540 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARNTP27540 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARNTP27540 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARNTP27540 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARNTP27540 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARNTP27540 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARNTP27540 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARNTP27540 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARNTP27540 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARNTP27540 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARNTP27540 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARNTP27540 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARNTP27540 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARNTP27540 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARNTP27540 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARNTP27540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARNTP27540 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARNTP27540 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARNTP27540 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARNTP27540 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARNTP27540 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARNTP27540 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARNTP27540 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARNTP27540 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARNTP27540 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARNTP27540 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARNTP27540 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARNTP27540 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARNTP27540 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARNTP27540 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARNTP27540 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARNTP27540 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARNTP27540 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARNTP27540 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARNTP27540 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARNTP27540 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARNTP27540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARNTP27540 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARNTP27540 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARNTP27540 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARNTP27540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARNTP27540 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARNTP27540 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARNTP27540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARNTP27540 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARNTP27540 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARNTP27540 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARNTP27540 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARNTP27540 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARNTP27540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARNTP27540 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARNTP27540 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARNTP27540 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARNTP27540 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARNTP27540 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARNTP27540 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms