Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA3P26006 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA3P26006 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA3P26006 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA3P26006 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA3P26006 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA3P26006 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms