Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNCP24821 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNCP24821 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNCP24821 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNCP24821 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNCP24821 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNCP24821 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNCP24821 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNCP24821 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNCP24821 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNCP24821 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNCP24821 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNCP24821 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TNCP24821 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNCP24821 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNCP24821 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNCP24821 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNCP24821 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNCP24821 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNCP24821 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNCP24821 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNCP24821 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNCP24821 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNCP24821 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNCP24821 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNCP24821 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNCP24821 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNCP24821 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNCP24821 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNCP24821 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNCP24821 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNCP24821 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNCP24821 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNCP24821 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNCP24821 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNCP24821 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNCP24821 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNCP24821 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNCP24821 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNCP24821 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNCP24821 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNCP24821 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNCP24821 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNCP24821 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNCP24821 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNCP24821 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNCP24821 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNCP24821 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNCP24821 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNCP24821 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNCP24821 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNCP24821 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNCP24821 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNCP24821 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNCP24821 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNCP24821 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNCP24821 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNCP24821 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNCP24821 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNCP24821 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNCP24821 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNCP24821 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNCP24821 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNCP24821 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNCP24821 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNCP24821 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNCP24821 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNCP24821 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNCP24821 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNCP24821 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNCP24821 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNCP24821 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNCP24821 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNCP24821 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNCP24821 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNCP24821 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNCP24821 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNCP24821 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNCP24821 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNCP24821 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNCP24821 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNCP24821 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNCP24821 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNCP24821 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNCP24821 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNCP24821 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNCP24821 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNCP24821 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNCP24821 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms