Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDELR1P24390 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDELR1P24390 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDELR1P24390 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDELR1P24390 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDELR1P24390 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDELR1P24390 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDELR1P24390 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDELR1P24390 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDELR1P24390 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDELR1P24390 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDELR1P24390 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDELR1P24390 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDELR1P24390 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms