Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGA6P23229 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGA6P23229 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGA6P23229 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGA6P23229 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ITGA6P23229 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGA6P23229 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGA6P23229 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms