Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1B2P21281 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1B2P21281 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6V1B2P21281 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1B2P21281 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP6V1B2P21281 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1B2P21281 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms