Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CASTP20810 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CASTP20810 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CASTP20810 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CASTP20810 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CASTP20810 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CASTP20810 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CASTP20810 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CASTP20810 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CASTP20810 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CASTP20810 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CASTP20810 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CASTP20810 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CASTP20810 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASTP20810 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASTP20810 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASTP20810 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASTP20810 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASTP20810 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CASTP20810 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CASTP20810 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CASTP20810 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CASTP20810 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CASTP20810 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASTP20810 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASTP20810 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASTP20810 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASTP20810 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASTP20810 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASTP20810 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASTP20810 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASTP20810 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASTP20810 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASTP20810 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASTP20810 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CASTP20810 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASTP20810 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASTP20810 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASTP20810 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CASTP20810 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CASTP20810 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASTP20810 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASTP20810 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASTP20810 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASTP20810 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASTP20810 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CASTP20810 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASTP20810 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASTP20810 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASTP20810 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CASTP20810 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASTP20810 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASTP20810 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASTP20810 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASTP20810 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASTP20810 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASTP20810 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASTP20810 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASTP20810 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASTP20810 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASTP20810 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASTP20810 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASTP20810 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASTP20810 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASTP20810 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASTP20810 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASTP20810 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASTP20810 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASTP20810 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASTP20810 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASTP20810 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CASTP20810 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASTP20810 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CASTP20810 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASTP20810 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASTP20810 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASTP20810 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CASTP20810 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CASTP20810 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CASTP20810 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASTP20810 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASTP20810 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASTP20810 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASTP20810 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASTP20810 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASTP20810 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASTP20810 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASTP20810 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASTP20810 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASTP20810 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms