Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN3P20807 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAPN3P20807 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN3P20807 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN3P20807 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN3P20807 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN3P20807 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms