Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCP1P17987 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP1P17987 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP1P17987 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP1P17987 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP1P17987 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP1P17987 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP1P17987 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP1P17987 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP1P17987 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP1P17987 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP1P17987 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP1P17987 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP1P17987 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP1P17987 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP1P17987 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP1P17987 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP1P17987 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP1P17987 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP1P17987 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP1P17987 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP1P17987 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP1P17987 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP1P17987 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP1P17987 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP1P17987 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP1P17987 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP1P17987 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP1P17987 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP1P17987 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP1P17987 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP1P17987 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP1P17987 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP1P17987 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP1P17987 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP1P17987 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP1P17987 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TCP1P17987 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TCP1P17987 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP1P17987 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP1P17987 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP1P17987 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP1P17987 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP1P17987 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP1P17987 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP1P17987 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP1P17987 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP1P17987 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP1P17987 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCP1P17987 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP1P17987 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP1P17987 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP1P17987 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP1P17987 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP1P17987 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP1P17987 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP1P17987 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP1P17987 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP1P17987 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP1P17987 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP1P17987 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP1P17987 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP1P17987 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP1P17987 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP1P17987 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP1P17987 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCP1P17987 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCP1P17987 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TCP1P17987 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCP1P17987 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP1P17987 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP1P17987 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP1P17987 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP1P17987 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP1P17987 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP1P17987 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP1P17987 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCP1P17987 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCP1P17987 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCP1P17987 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP1P17987 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP1P17987 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP1P17987 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP1P17987 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP1P17987 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP1P17987 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP1P17987 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP1P17987 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP1P17987 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP1P17987 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP1P17987 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP1P17987 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP1P17987 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP1P17987 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP1P17987 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 568.3 ms