Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB6P17509 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB6P17509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB6P17509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB6P17509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB6P17509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB6P17509 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms