Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTLA4P16410 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTLA4P16410 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTLA4P16410 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTLA4P16410 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTLA4P16410 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTLA4P16410 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms