Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFAPP14136 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GFAPP14136 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFAPP14136 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFAPP14136 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFAPP14136 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFAPP14136 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFAPP14136 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GFAPP14136 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFAPP14136 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFAPP14136 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFAPP14136 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFAPP14136 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFAPP14136 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFAPP14136 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFAPP14136 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFAPP14136 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFAPP14136 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GFAPP14136 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFAPP14136 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFAPP14136 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFAPP14136 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
GFAPP14136 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFAPP14136 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFAPP14136 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFAPP14136 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFAPP14136 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFAPP14136 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFAPP14136 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFAPP14136 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFAPP14136 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFAPP14136 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFAPP14136 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFAPP14136 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFAPP14136 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFAPP14136 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GFAPP14136 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFAPP14136 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFAPP14136 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFAPP14136 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFAPP14136 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFAPP14136 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFAPP14136 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFAPP14136 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFAPP14136 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFAPP14136 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFAPP14136 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GFAPP14136 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFAPP14136 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GFAPP14136 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFAPP14136 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFAPP14136 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFAPP14136 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFAPP14136 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFAPP14136 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFAPP14136 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFAPP14136 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFAPP14136 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GFAPP14136 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFAPP14136 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFAPP14136 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFAPP14136 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFAPP14136 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFAPP14136 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFAPP14136 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFAPP14136 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFAPP14136 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GFAPP14136 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GFAPP14136 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GFAPP14136 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFAPP14136 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFAPP14136 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFAPP14136 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFAPP14136 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFAPP14136 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFAPP14136 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFAPP14136 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFAPP14136 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFAPP14136 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms