Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SKIP12755 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKIP12755 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKIP12755 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKIP12755 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SKIP12755 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SKIP12755 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKIP12755 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKIP12755 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKIP12755 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKIP12755 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SKIP12755 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKIP12755 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKIP12755 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKIP12755 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKIP12755 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKIP12755 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKIP12755 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKIP12755 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKIP12755 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKIP12755 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKIP12755 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKIP12755 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKIP12755 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKIP12755 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKIP12755 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIP12755 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIP12755 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIP12755 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIP12755 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIP12755 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKIP12755 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKIP12755 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKIP12755 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKIP12755 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIP12755 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIP12755 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIP12755 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIP12755 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIP12755 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SKIP12755 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIP12755 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIP12755 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIP12755 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIP12755 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIP12755 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKIP12755 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKIP12755 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKIP12755 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKIP12755 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKIP12755 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKIP12755 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKIP12755 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKIP12755 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKIP12755 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SKIP12755 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKIP12755 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKIP12755 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKIP12755 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKIP12755 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKIP12755 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKIP12755 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKIP12755 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKIP12755 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKIP12755 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKIP12755 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKIP12755 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKIP12755 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKIP12755 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKIP12755 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKIP12755 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKIP12755 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKIP12755 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKIP12755 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKIP12755 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKIP12755 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKIP12755 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKIP12755 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKIP12755 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKIP12755 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIP12755 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIP12755 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIP12755 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIP12755 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIP12755 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIP12755 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIP12755 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIP12755 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIP12755 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKIP12755 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKIP12755 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms