Protein–RNA interactions for Protein: P11908

PRPS2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS2P11908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPS2P11908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPS2P11908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPS2P11908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPS2P11908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPS2P11908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPS2P11908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS2P11908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms