Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPCP11686 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFTPCP11686 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPCP11686 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFTPCP11686 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPCP11686 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms