Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UMPSP11172 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UMPSP11172 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UMPSP11172 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UMPSP11172 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UMPSP11172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UMPSP11172 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UMPSP11172 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UMPSP11172 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UMPSP11172 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UMPSP11172 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UMPSP11172 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UMPSP11172 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UMPSP11172 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UMPSP11172 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UMPSP11172 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UMPSP11172 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UMPSP11172 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UMPSP11172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UMPSP11172 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UMPSP11172 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UMPSP11172 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UMPSP11172 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UMPSP11172 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UMPSP11172 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UMPSP11172 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UMPSP11172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UMPSP11172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UMPSP11172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UMPSP11172 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UMPSP11172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UMPSP11172 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UMPSP11172 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UMPSP11172 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UMPSP11172 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UMPSP11172 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UMPSP11172 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UMPSP11172 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UMPSP11172 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UMPSP11172 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UMPSP11172 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UMPSP11172 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UMPSP11172 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UMPSP11172 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UMPSP11172 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UMPSP11172 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UMPSP11172 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UMPSP11172 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UMPSP11172 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UMPSP11172 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UMPSP11172 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UMPSP11172 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UMPSP11172 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UMPSP11172 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UMPSP11172 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UMPSP11172 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UMPSP11172 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UMPSP11172 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UMPSP11172 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UMPSP11172 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UMPSP11172 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UMPSP11172 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UMPSP11172 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UMPSP11172 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UMPSP11172 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UMPSP11172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UMPSP11172 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UMPSP11172 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UMPSP11172 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UMPSP11172 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UMPSP11172 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UMPSP11172 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UMPSP11172 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UMPSP11172 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UMPSP11172 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UMPSP11172 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UMPSP11172 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UMPSP11172 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UMPSP11172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UMPSP11172 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UMPSP11172 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UMPSP11172 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UMPSP11172 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UMPSP11172 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UMPSP11172 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UMPSP11172 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UMPSP11172 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UMPSP11172 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UMPSP11172 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms