Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L7P0C7H9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L7P0C7H9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L7P0C7H9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L7P0C7H9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L7P0C7H9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms