Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT16P08779 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT16P08779 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT16P08779 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT16P08779 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT16P08779 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT16P08779 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT16P08779 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT16P08779 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT16P08779 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT16P08779 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT16P08779 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT16P08779 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT16P08779 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT16P08779 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT16P08779 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT16P08779 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT16P08779 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT16P08779 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT16P08779 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT16P08779 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT16P08779 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT16P08779 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT16P08779 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT16P08779 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT16P08779 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT16P08779 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT16P08779 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT16P08779 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT16P08779 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT16P08779 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT16P08779 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT16P08779 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT16P08779 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT16P08779 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT16P08779 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT16P08779 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT16P08779 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT16P08779 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT16P08779 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT16P08779 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT16P08779 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT16P08779 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT16P08779 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT16P08779 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT16P08779 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT16P08779 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT16P08779 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT16P08779 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT16P08779 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT16P08779 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT16P08779 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT16P08779 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT16P08779 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT16P08779 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT16P08779 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT16P08779 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT16P08779 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT16P08779 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT16P08779 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT16P08779 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT16P08779 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT16P08779 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT16P08779 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT16P08779 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT16P08779 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KRT16P08779 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT16P08779 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT16P08779 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT16P08779 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT16P08779 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT16P08779 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT16P08779 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT16P08779 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT16P08779 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT16P08779 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT16P08779 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT16P08779 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT16P08779 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT16P08779 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT16P08779 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT16P08779 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT16P08779 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT16P08779 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT16P08779 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT16P08779 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT16P08779 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT16P08779 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT16P08779 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms