Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB1P08183 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB1P08183 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCB1P08183 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB1P08183 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB1P08183 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB1P08183 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms