Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPLP06858 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPLP06858 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPLP06858 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPLP06858 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPLP06858 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPLP06858 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPLP06858 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPLP06858 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPLP06858 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPLP06858 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPLP06858 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPLP06858 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPLP06858 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPLP06858 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPLP06858 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPLP06858 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPLP06858 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPLP06858 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPLP06858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPLP06858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPLP06858 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPLP06858 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPLP06858 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPLP06858 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPLP06858 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPLP06858 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPLP06858 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPLP06858 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPLP06858 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPLP06858 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPLP06858 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPLP06858 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPLP06858 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPLP06858 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPLP06858 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPLP06858 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPLP06858 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPLP06858 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPLP06858 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPLP06858 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPLP06858 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPLP06858 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPLP06858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPLP06858 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPLP06858 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LPLP06858 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPLP06858 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPLP06858 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPLP06858 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPLP06858 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LPLP06858 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPLP06858 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPLP06858 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPLP06858 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPLP06858 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPLP06858 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPLP06858 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPLP06858 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPLP06858 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPLP06858 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPLP06858 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPLP06858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPLP06858 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPLP06858 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPLP06858 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPLP06858 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPLP06858 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPLP06858 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LPLP06858 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPLP06858 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPLP06858 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPLP06858 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPLP06858 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPLP06858 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPLP06858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPLP06858 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms