Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TYMSP04818 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TYMSP04818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYMSP04818 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYMSP04818 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYMSP04818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TYMSP04818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYMSP04818 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYMSP04818 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TYMSP04818 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TYMSP04818 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYMSP04818 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYMSP04818 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TYMSP04818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYMSP04818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYMSP04818 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYMSP04818 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TYMSP04818 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYMSP04818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TYMSP04818 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TYMSP04818 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TYMSP04818 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYMSP04818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYMSP04818 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYMSP04818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYMSP04818 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYMSP04818 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYMSP04818 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYMSP04818 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYMSP04818 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYMSP04818 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYMSP04818 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYMSP04818 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYMSP04818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYMSP04818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYMSP04818 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYMSP04818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYMSP04818 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYMSP04818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYMSP04818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYMSP04818 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYMSP04818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYMSP04818 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYMSP04818 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYMSP04818 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TYMSP04818 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYMSP04818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYMSP04818 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYMSP04818 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TYMSP04818 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYMSP04818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYMSP04818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYMSP04818 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYMSP04818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYMSP04818 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYMSP04818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYMSP04818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYMSP04818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYMSP04818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYMSP04818 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYMSP04818 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYMSP04818 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYMSP04818 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYMSP04818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYMSP04818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYMSP04818 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYMSP04818 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYMSP04818 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYMSP04818 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYMSP04818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYMSP04818 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYMSP04818 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYMSP04818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYMSP04818 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYMSP04818 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYMSP04818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYMSP04818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYMSP04818 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYMSP04818 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYMSP04818 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYMSP04818 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYMSP04818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYMSP04818 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYMSP04818 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYMSP04818 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYMSP04818 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYMSP04818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYMSP04818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYMSP04818 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYMSP04818 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYMSP04818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYMSP04818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYMSP04818 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYMSP04818 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms