Protein–RNA interactions for Protein: P02747

C1QC, Complement C1q subcomponent subunit C, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QCP02747 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QCP02747 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QCP02747 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QCP02747 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1QCP02747 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QCP02747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QCP02747 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1QCP02747 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1QCP02747 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QCP02747 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1QCP02747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QCP02747 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QCP02747 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1QCP02747 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QCP02747 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1QCP02747 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1QCP02747 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QCP02747 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QCP02747 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1QCP02747 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QCP02747 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1QCP02747 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1QCP02747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QCP02747 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QCP02747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1QCP02747 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QCP02747 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1QCP02747 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QCP02747 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C1QCP02747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QCP02747 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1QCP02747 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1QCP02747 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1QCP02747 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QCP02747 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1QCP02747 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QCP02747 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QCP02747 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1QCP02747 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QCP02747 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QCP02747 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QCP02747 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QCP02747 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1QCP02747 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QCP02747 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1QCP02747 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1QCP02747 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1QCP02747 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QCP02747 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QCP02747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1QCP02747 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QCP02747 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QCP02747 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1QCP02747 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1QCP02747 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QCP02747 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QCP02747 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QCP02747 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QCP02747 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QCP02747 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QCP02747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QCP02747 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QCP02747 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1QCP02747 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1QCP02747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QCP02747 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QCP02747 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QCP02747 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QCP02747 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QCP02747 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QCP02747 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QCP02747 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QCP02747 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QCP02747 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QCP02747 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QCP02747 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms