Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC3P02656 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC3P02656 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC3P02656 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOC3P02656 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOC3P02656 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC3P02656 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC3P02656 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC3P02656 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOC3P02656 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC3P02656 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC3P02656 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOC3P02656 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOC3P02656 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC3P02656 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC3P02656 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOC3P02656 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC3P02656 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOC3P02656 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC3P02656 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC3P02656 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC3P02656 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOC3P02656 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC3P02656 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC3P02656 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOC3P02656 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC3P02656 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC3P02656 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOC3P02656 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC3P02656 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC3P02656 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC3P02656 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC3P02656 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC3P02656 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC3P02656 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC3P02656 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOC3P02656 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC3P02656 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC3P02656 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC3P02656 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC3P02656 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC3P02656 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC3P02656 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC3P02656 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC3P02656 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC3P02656 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC3P02656 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC3P02656 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC3P02656 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC3P02656 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC3P02656 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC3P02656 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC3P02656 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC3P02656 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC3P02656 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC3P02656 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC3P02656 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC3P02656 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC3P02656 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC3P02656 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC3P02656 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC3P02656 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC3P02656 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC3P02656 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC3P02656 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC3P02656 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC3P02656 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC3P02656 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC3P02656 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC3P02656 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC3P02656 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOC3P02656 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC3P02656 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC3P02656 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC3P02656 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC3P02656 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC3P02656 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC3P02656 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC3P02656 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC3P02656 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC3P02656 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC3P02656 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC3P02656 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC3P02656 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC3P02656 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC3P02656 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC3P02656 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC3P02656 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC3P02656 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC3P02656 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC3P02656 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC3P02656 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC3P02656 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC3P02656 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC3P02656 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms