Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01737 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01737 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01737 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01737 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01737 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01737 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01737 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01737 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01737 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01737 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01737 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01737 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01737 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01737 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01737 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01737 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01737 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01737 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01737 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01737 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01737 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01737 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01737 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01737 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01737 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01737 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01737 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01737 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01737 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01737 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01737 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01737 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01737 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01737 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01737 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01737 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01737 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01737 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01737 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01737 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01737 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01737 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01737 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01737 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01737 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01737 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01737 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01737 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01737 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01737 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P01737 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P01737 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P01737 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P01737 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P01737 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P01737 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P01737 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P01737 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P01737 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P01737 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P01737 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
P01737 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01737 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P01737 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P01737 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P01737 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P01737 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P01737 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
P01737 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P01737 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P01737 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
P01737 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P01737 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P01737 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P01737 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01737 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms