Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IGKV1-17P01599 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IGKV1-17P01599 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGKV1-17P01599 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGKV1-17P01599 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGKV1-17P01599 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV1-17P01599 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms