Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POMCP01189 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
POMCP01189 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POMCP01189 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POMCP01189 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POMCP01189 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
POMCP01189 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POMCP01189 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POMCP01189 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POMCP01189 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POMCP01189 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POMCP01189 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POMCP01189 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POMCP01189 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POMCP01189 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POMCP01189 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POMCP01189 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
POMCP01189 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMCP01189 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMCP01189 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POMCP01189 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POMCP01189 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POMCP01189 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POMCP01189 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POMCP01189 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POMCP01189 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POMCP01189 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
POMCP01189 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POMCP01189 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POMCP01189 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POMCP01189 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POMCP01189 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POMCP01189 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POMCP01189 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POMCP01189 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POMCP01189 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POMCP01189 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POMCP01189 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POMCP01189 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POMCP01189 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POMCP01189 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POMCP01189 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POMCP01189 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POMCP01189 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POMCP01189 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POMCP01189 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POMCP01189 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POMCP01189 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POMCP01189 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POMCP01189 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POMCP01189 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POMCP01189 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POMCP01189 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POMCP01189 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POMCP01189 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POMCP01189 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMCP01189 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMCP01189 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMCP01189 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMCP01189 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POMCP01189 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMCP01189 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMCP01189 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POMCP01189 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POMCP01189 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POMCP01189 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POMCP01189 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POMCP01189 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POMCP01189 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POMCP01189 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POMCP01189 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POMCP01189 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POMCP01189 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMCP01189 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POMCP01189 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMCP01189 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMCP01189 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POMCP01189 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POMCP01189 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POMCP01189 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POMCP01189 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POMCP01189 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POMCP01189 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POMCP01189 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POMCP01189 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POMCP01189 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POMCP01189 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POMCP01189 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMCP01189 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMCP01189 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMCP01189 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POMCP01189 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POMCP01189 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMCP01189 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMCP01189 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMCP01189 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POMCP01189 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POMCP01189 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POMCP01189 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POMCP01189 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms