Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPTM1O96005 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPTM1O96005 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPTM1O96005 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPTM1O96005 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPTM1O96005 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLPTM1O96005 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1O96005 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms