Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR47O94967 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR47O94967 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR47O94967 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR47O94967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR47O94967 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR47O94967 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR47O94967 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR47O94967 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR47O94967 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR47O94967 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR47O94967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR47O94967 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR47O94967 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR47O94967 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR47O94967 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR47O94967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR47O94967 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR47O94967 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR47O94967 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR47O94967 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR47O94967 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR47O94967 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR47O94967 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR47O94967 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR47O94967 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR47O94967 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR47O94967 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR47O94967 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR47O94967 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR47O94967 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR47O94967 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR47O94967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms