Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTN1O94822 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTN1O94822 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTN1O94822 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTN1O94822 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LTN1O94822 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LTN1O94822 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LTN1O94822 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LTN1O94822 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LTN1O94822 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LTN1O94822 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LTN1O94822 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LTN1O94822 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LTN1O94822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LTN1O94822 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
LTN1O94822 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LTN1O94822 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
LTN1O94822 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LTN1O94822 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LTN1O94822 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LTN1O94822 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTN1O94822 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
LTN1O94822 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTN1O94822 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTN1O94822 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTN1O94822 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTN1O94822 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTN1O94822 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTN1O94822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTN1O94822 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTN1O94822 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTN1O94822 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTN1O94822 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LTN1O94822 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LTN1O94822 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
LTN1O94822 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LTN1O94822 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LTN1O94822 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LTN1O94822 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LTN1O94822 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTN1O94822 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTN1O94822 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTN1O94822 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTN1O94822 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
LTN1O94822 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTN1O94822 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTN1O94822 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
LTN1O94822 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LTN1O94822 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LTN1O94822 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
LTN1O94822 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTN1O94822 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTN1O94822 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTN1O94822 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTN1O94822 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTN1O94822 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTN1O94822 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LTN1O94822 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LTN1O94822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
LTN1O94822 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LTN1O94822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
LTN1O94822 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
LTN1O94822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LTN1O94822 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LTN1O94822 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LTN1O94822 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTN1O94822 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTN1O94822 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTN1O94822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LTN1O94822 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTN1O94822 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTN1O94822 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTN1O94822 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTN1O94822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTN1O94822 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTN1O94822 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LTN1O94822 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LTN1O94822 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LTN1O94822 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LTN1O94822 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LTN1O94822 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LTN1O94822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTN1O94822 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTN1O94822 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTN1O94822 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTN1O94822 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTN1O94822 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTN1O94822 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTN1O94822 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTN1O94822 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTN1O94822 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTN1O94822 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LTN1O94822 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LTN1O94822 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTN1O94822 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTN1O94822 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTN1O94822 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTN1O94822 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTN1O94822 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LTN1O94822 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms