Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPXO76031 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPXO76031 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPXO76031 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPXO76031 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPXO76031 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPXO76031 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPXO76031 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPXO76031 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPXO76031 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPXO76031 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPXO76031 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPXO76031 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPXO76031 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPXO76031 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPXO76031 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPXO76031 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPXO76031 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLPXO76031 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPXO76031 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPXO76031 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPXO76031 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPXO76031 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPXO76031 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPXO76031 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPXO76031 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPXO76031 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPXO76031 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPXO76031 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPXO76031 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPXO76031 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPXO76031 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPXO76031 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPXO76031 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPXO76031 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPXO76031 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPXO76031 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPXO76031 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPXO76031 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPXO76031 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPXO76031 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPXO76031 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPXO76031 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPXO76031 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPXO76031 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPXO76031 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPXO76031 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPXO76031 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPXO76031 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPXO76031 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPXO76031 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPXO76031 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLPXO76031 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPXO76031 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLPXO76031 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLPXO76031 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPXO76031 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPXO76031 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPXO76031 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPXO76031 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPXO76031 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPXO76031 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLPXO76031 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLPXO76031 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLPXO76031 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPXO76031 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPXO76031 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPXO76031 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPXO76031 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPXO76031 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPXO76031 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPXO76031 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPXO76031 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPXO76031 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPXO76031 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPXO76031 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPXO76031 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLPXO76031 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPXO76031 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPXO76031 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPXO76031 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPXO76031 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPXO76031 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPXO76031 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPXO76031 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms