Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSDE1O75534 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSDE1O75534 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSDE1O75534 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSDE1O75534 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSDE1O75534 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSDE1O75534 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CSDE1O75534 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSDE1O75534 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSDE1O75534 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSDE1O75534 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSDE1O75534 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms