Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ULK1O75385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ULK1O75385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ULK1O75385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ULK1O75385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ULK1O75385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ULK1O75385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ULK1O75385 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ULK1O75385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ULK1O75385 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ULK1O75385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ULK1O75385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ULK1O75385 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK1O75385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK1O75385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK1O75385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK1O75385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK1O75385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK1O75385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK1O75385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK1O75385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK1O75385 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK1O75385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK1O75385 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK1O75385 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK1O75385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK1O75385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK1O75385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK1O75385 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK1O75385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK1O75385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK1O75385 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK1O75385 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK1O75385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK1O75385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK1O75385 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK1O75385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ULK1O75385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ULK1O75385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK1O75385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK1O75385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK1O75385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK1O75385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK1O75385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK1O75385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK1O75385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK1O75385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK1O75385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK1O75385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK1O75385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK1O75385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK1O75385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK1O75385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK1O75385 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK1O75385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK1O75385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK1O75385 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK1O75385 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK1O75385 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK1O75385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK1O75385 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK1O75385 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK1O75385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK1O75385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK1O75385 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK1O75385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK1O75385 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK1O75385 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK1O75385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK1O75385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK1O75385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK1O75385 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ULK1O75385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK1O75385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK1O75385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK1O75385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK1O75385 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ULK1O75385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK1O75385 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK1O75385 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK1O75385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK1O75385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ULK1O75385 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ULK1O75385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK1O75385 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK1O75385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK1O75385 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ULK1O75385 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ULK1O75385 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ULK1O75385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ULK1O75385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ULK1O75385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ULK1O75385 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ULK1O75385 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK1O75385 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK1O75385 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK1O75385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK1O75385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ULK1O75385 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ULK1O75385 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms