Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIA4O75335 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA4O75335 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA4O75335 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA4O75335 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA4O75335 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA4O75335 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA4O75335 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PPFIA4O75335 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms