Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
DENND4BO75064 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
DENND4BO75064 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
DENND4BO75064 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
DENND4BO75064 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
DENND4BO75064 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
DENND4BO75064 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DENND4BO75064 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
DENND4BO75064 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
DENND4BO75064 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms