Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LPXNO60711 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LPXNO60711 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LPXNO60711 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LPXNO60711 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LPXNO60711 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LPXNO60711 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LPXNO60711 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LPXNO60711 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LPXNO60711 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LPXNO60711 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LPXNO60711 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPXNO60711 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPXNO60711 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPXNO60711 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPXNO60711 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LPXNO60711 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LPXNO60711 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPXNO60711 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LPXNO60711 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LPXNO60711 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LPXNO60711 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPXNO60711 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPXNO60711 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LPXNO60711 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LPXNO60711 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPXNO60711 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPXNO60711 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LPXNO60711 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms